台湾地处亚热带，早期来自大陆的移民多无法适应这里的气候，死于瘴疠时疫者，时有所闻。因此，端午这个以驱疾避疫为基本精神的节日，便颢得格外重要。
前清时期的端午习俗，可以王瑛曾的《重修凤山县志》(十七六四年)卷三附录中的记述为代表：五月五日清晨，燃稻梗一束，向室隅熏之，用楮钱送于路旁，名日送蚊。门楣悬蒲艾兼插禾稗，谓可避蚊蚋;榕一枝，谓老而弥健。彼此以西瓜、角黍相馈遗。好事者于海口浅处，用钱或布为标，三皮渔般争相夺取，胜者鸣锣喝采，号日斗龙舟。午为小儿女结五采缕，男系左腕，女系右腕，名日神炼。
民间另有一种说法，认为插艾、榕能使身体强健。俗话说「插榕较勇龙，插艾较勇健」。私塾里的学生，照例要在端什节送红包给先生作谢礼，先生则以一把扇子作为回礼。
铃木清一郎的《台湾旧惯冠婚葬祭年中行事》(一九三四年)记载，丧期中的家庭，端午节不包粽子，而是由亲友赠送，称之为「送节」。丧家则以糖做为回礼。而农家把称为「福金」的金纸来在竹竿上，插在间，据说可以防害而获丰收。有些地方在端午节有作「咸茶」的习俗，就是用盐来腌紫苏叶和蕃石榴叶，据说可以当药茶，清除一切毒气。
日治时代的屏东县佳冬乡，还有在端午节这天打石战的习俗。石战在佳冬地区已流传了数百年，每年到了端午节前几天，众人纷纷拳擦掌，准备打场硬仗。石战以村落为单位，组织一如军队，并设有参谋长等职位。组织一如军队，并设有参谋长等职位。男人在「前线」掷石作战。妇女则在后方负责运送石头。单况泪烈时，动辄造成伤亡。战胜的一方可至战败的村子大肆吃喝一番。战败的村民则落荒而逃。若不幸被对方俘虏了，会被强迫脱裤处罚，当众羞辱一番。这项奇特的习俗，据说可保一整年好运，所以佳冬人乐此不疲。但是因为石战常造成严重的伤亡，再加上地方政府一再的禁止，遂在日治末期逐渐式微。
端午节，家家户户还有打「午时水」的风俗。午时水指的就是端午节中午打上的井水。据说午时水用来泡茶酿酒特别香醇，生饮甚至具有治病的奇效。有谚语道：「午时洗目睭(眼睛)，明到若乌鹙」，又说「午时水饮一嘴，较好补药吃三年」。最富传奇色彩的午时水，则来自大甲镇砧山上的剑井。传说井是当年郑成功插剑祷泉的地点，而自又相传鎑砧山盛产各种灵药仙草，于是剑井午时水的功效便被传说得神奇无比。每年端午节，剑井旁边争没午时水的人总是挤得密不通风。据说端午节正午对着井中仔细观看，还可以看见郑成功的那把影。而看见剑影的人，这一年一定无灾厄。